Ers ei ddarganfod yn Djibouti yn 2012, mae'r mosgito Anopheles stephensi Asiaidd wedi lledu ledled Corn Affrica. Mae'r fector ymledol hwn yn parhau i ledaenu ar draws y cyfandir, gan beri bygythiad difrifol i raglenni rheoli malaria. Mae dulliau rheoli fectorau, gan gynnwys rhwydi gwely wedi'u trin â phryfladdwyr a chwistrellu gweddillion dan do, wedi lleihau baich malaria yn sylweddol. Fodd bynnag, mae'r cynnydd mewn nifer y mosgitos sy'n gwrthsefyll pryfleiddiaid, gan gynnwys poblogaethau Anopheles stephensi, yn llesteirio ymdrechion parhaus i ddileu malaria. Mae deall strwythur poblogaeth, llif genynnau rhwng poblogaethau, a dosbarthiad mwtaniadau gwrthsefyll pryfleiddiaid yn hanfodol i arwain strategaethau rheoli malaria effeithiol.
Mae gwella ein dealltwriaeth o sut y daeth An. stephensi mor sefydledig yn yr Ardal Goedwig yn hanfodol i ragweld ei lledaeniad posibl i ardaloedd newydd. Defnyddiwyd geneteg poblogaeth yn helaeth i astudio rhywogaethau fector er mwyn cael cipolwg ar strwythur y boblogaeth, detholiad parhaus, a llif genynnau18,19. Ar gyfer An. stephensi, gall astudio strwythur y boblogaeth a strwythur y genom helpu i egluro ei lwybr goresgyniad ac unrhyw esblygiad addasol a allai fod wedi digwydd ers iddo ymddangos. Yn ogystal â llif genynnau, mae detholiad yn arbennig o bwysig oherwydd gall nodi alelau sy'n gysylltiedig â gwrthwynebiad i bryfleiddiaid a thaflu goleuni ar sut mae'r alelau hyn yn lledaenu trwy'r boblogaeth20.
Hyd yn hyn, mae profi marcwyr ymwrthedd i bryfleiddiaid a geneteg poblogaeth yn y rhywogaeth ymledol Anopheles stephensi wedi'i gyfyngu i ychydig o enynnau ymgeisydd. Nid yw ymddangosiad y rhywogaeth yn Affrica wedi'i ddeall yn llawn, ond un ddamcaniaeth yw iddi gael ei chyflwyno gan bobl neu dda byw. Mae damcaniaethau eraill yn cynnwys mudo pellter hir gan y gwynt. Casglwyd yr ynysyddion Ethiopiaidd a ddefnyddiwyd yn yr astudiaeth hon yn Awash Sebat Kilo, tref sydd wedi'i lleoli 200 km i'r dwyrain o Addis Ababa ac ar y prif goridor trafnidiaeth o Addis Ababa i Djibouti. Mae Awash Sebat Kilo yn ardal â throsglwyddiad malaria uchel ac mae ganddi boblogaeth fawr o Anopheles stephensi, y dywedir ei fod yn gwrthsefyll pryfleiddiaid, gan ei gwneud yn safle pwysig ar gyfer astudio geneteg poblogaeth Anopheles stephensi8.
Canfuwyd y mwtaniad ymwrthedd i bryfleiddiaid kdr L1014F ar amledd isel ym mhoblogaeth Ethiopia ac ni chanfuwyd ef yn y samplau maes yn India. Mae'r mwtaniad kdr hwn yn rhoi ymwrthedd i byrethroidau a DDT ac fe'i canfuwyd yn flaenorol mewn poblogaethau An. stephensi a gasglwyd yn India yn 2016 ac Afghanistan yn 2018.31,32 Er gwaethaf tystiolaeth o ymwrthedd eang i byrethroid yn y ddwy ddinas, ni chanfuwyd y mwtaniad kdr L1014F ym mhoblogaethau Mangalore a Bangalore a ddadansoddwyd yma. Mae'r gyfran isel o ynysyddion Ethiopia sy'n cario'r SNP hwn a oedd yn heterosygaidd yn awgrymu bod y mwtaniad wedi codi'n ddiweddar yn y boblogaeth hon. Cefnogir hyn gan astudiaeth flaenorol yn Awash nad oedd wedi canfod unrhyw dystiolaeth o'r mwtaniad kdr mewn samplau a gasglwyd yn y flwyddyn cyn y rhai a ddadansoddwyd yma.18 Fe wnaethom nodi'r mwtaniad kdr L1014F hwn yn flaenorol ar amledd isel mewn set o samplau o'r un rhanbarth/blwyddyn gan ddefnyddio dull canfod amplicon.28 O ystyried yr ymwrthedd ffenoteipig yn y safleoedd samplu, mae amlder alel isel y marcwr ymwrthedd hwn yn awgrymu bod mecanweithiau heblaw addasu'r safle targed yn gyfrifol am y ffenoteip hwn a welwyd.
Un cyfyngiad ar yr astudiaeth hon yw'r diffyg data ffenoteipig ar ymateb i bryfleiddiaid. Mae angen astudiaethau pellach sy'n cyfuno dilyniannu'r genom cyfan (WGS) neu ddilyniannu amplicon wedi'i dargedu ar y cyd â bioasayau sensitifrwydd i ymchwilio i effaith y mwtaniadau hyn ar ymateb i bryfleiddiaid. Dylid targedu'r SNPs camsynnwyr newydd hyn a allai fod yn gysylltiedig ag ymwrthedd ar gyfer asesiadau moleciwlaidd trwybwn uchel i gefnogi monitro a hwyluso gwaith swyddogaethol i ddeall a dilysu mecanweithiau posibl sy'n gysylltiedig â ffenoteipiau ymwrthedd.
I grynhoi, mae'r astudiaeth hon yn darparu dealltwriaeth ddyfnach o eneteg poblogaethau mosgito Anopheles ar draws cyfandiroedd. Bydd cymhwyso dadansoddiad dilyniannu genom cyfan (WGS) i garfannau mwy o samplau mewn gwahanol ranbarthau daearyddol yn allweddol i ddeall llif genynnau ac adnabod marcwyr ymwrthedd i bryfleiddiaid. Bydd y wybodaeth hon yn galluogi awdurdodau iechyd cyhoeddus i wneud dewisiadau gwybodus wrth fonitro fectorau a defnyddio pryfleiddiaid.
Defnyddiwyd dau ddull i ganfod amrywiad nifer copïau yn y set ddata hon. Yn gyntaf, defnyddiwyd dull yn seiliedig ar orchudd a oedd yn canolbwyntio ar glystyrau genynnau CYP a nodwyd yn y genom (Tabl Atodol S5). Cyfartaleddwyd gorchudd sampl ar draws lleoliadau casglu a'i rannu'n bedwar grŵp: Ethiopia, caeau Indiaidd, trefedigaethau Indiaidd, a threfedigaethau Pacistanaidd. Normaleiddiwyd gorchudd pob grŵp gan ddefnyddio llyfnhau cnewyllyn ac yna ei blotio yn ôl dyfnder canolrif gorchudd y genom ar gyfer y grŵp hwnnw.
Amser postio: Mehefin-23-2025